MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 chromosome

Total Repeats: 5422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015978	A	7	7	20	26	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015978	CTT	2	6	224	229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015978	TTA	2	6	238	243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015978	AT	3	6	281	286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015978	T	6	6	315	320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015978	AAT	2	6	1738	1743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015978	CTA	3	9	1873	1881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015978	TTA	2	6	1896	1901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015978	A	6	6	3096	3101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015978	T	7	7	3124	3130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015978	TTAT	2	8	3144	3151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015978	A	6	6	3214	3219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015978	GTAA	2	8	3229	3236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015978	GAG	2	6	4602	4607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015978	T	6	6	9135	9140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015978	T	6	6	9153	9158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015978	AAT	3	9	9203	9211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015978	ATATA	2	10	9222	9231	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015978	AGG	2	6	9299	9304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015978	GAG	2	6	9625	9630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015978	GAG	2	6	10180	10185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015978	A	6	6	10188	10193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015978	GAA	2	6	10223	10228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015978	T	7	7	10489	10495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015978	ATAGA	2	10	10523	10532	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015978	AGT	2	6	10539	10544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015978	T	6	6	14564	14569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015978	GAG	2	6	14617	14622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015978	T	7	7	15610	15616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015978	A	6	6	15636	15641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015978	TCCT	2	8	15661	15668	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015978	ATG	2	6	15673	15678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015978	AT	3	6	15767	15772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015978	T	6	6	15822	15827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015978	GTG	2	6	15839	15844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015978	GTTAT	2	10	15866	15875	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015978	TTA	2	6	18562	18567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015978	T	7	7	21520	21526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015978	A	6	6	21602	21607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015978	T	7	7	21685	21691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015978	ACGA	2	8	21696	21703	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015978	A	7	7	21746	21752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015978	AGC	2	6	21831	21836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015978	TAA	2	6	21837	21842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015978	GT	3	6	21865	21870	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015978	T	7	7	21896	21902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015978	TAA	2	6	21913	21918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015978	A	6	6	21984	21989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015978	ACA	2	6	21997	22002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015978	A	6	6	22009	22014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015978	AAG	2	6	22037	22042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015978	T	6	6	24517	24522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015978	ATA	2	6	24567	24572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015978	AGG	2	6	24589	24594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015978	GCA	2	6	24626	24631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015978	TGG	2	6	24688	24693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015978	AATT	2	8	24697	24704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015978	GAA	2	6	24725	24730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015978	A	7	7	24729	24735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015978	GCC	2	6	24785	24790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_015978	AGA	2	6	24883	24888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015978	ATT	2	6	24945	24950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015978	T	6	6	24975	24980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015978	AGT	2	6	25003	25008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015978	A	6	6	25158	25163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015978	ATGG	2	8	25319	25326	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015978	AGC	2	6	25396	25401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015978	GGA	2	6	25442	25447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015978	GTC	2	6	25527	25532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015978	CAA	2	6	25566	25571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015978	TTG	2	6	25575	25580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015978	TGC	2	6	25591	25596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015978	AGC	2	6	25630	25635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015978	CTA	2	6	25815	25820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015978	TTTG	2	8	25840	25847	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015978	AAG	2	6	26040	26045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015978	ATT	2	6	26139	26144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015978	CTTG	2	8	26203	26210	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015978	ATC	2	6	26226	26231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015978	AGA	2	6	26281	26286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015978	CAA	2	6	26309	26314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015978	ATT	2	6	26341	26346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015978	ACT	2	6	26385	26390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015978	ATG	2	6	26400	26405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015978	A	7	7	26415	26421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015978	A	7	7	26440	26446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015978	T	6	6	26455	26460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015978	TGAA	2	8	27802	27809	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015978	TAT	2	6	27860	27865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015978	A	6	6	27910	27915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015978	ATT	2	6	27941	27946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015978	TGA	2	6	27951	27956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015978	ATT	3	9	27961	27969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015978	AAT	2	6	28022	28027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015978	TAA	2	6	28043	28048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015978	AGAA	2	8	28068	28075	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015978	T	6	6	28909	28914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015978	T	6	6	28919	28924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015978	ATT	2	6	28941	28946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015978	A	6	6	30028	30033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015978	TAA	3	9	31274	31282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015978	ATT	2	6	31285	31290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015978	TAAT	2	8	31324	31331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015978	TGT	2	6	31365	31370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015978	GTTA	2	8	31389	31396	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015978	ATTTT	2	10	31424	31433	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015978	CTA	2	6	31442	31447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015978	TA	3	6	31449	31454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015978	AAAG	2	8	31470	31477	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015978	TAA	2	6	31544	31549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015978	TAAA	2	8	31569	31576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015978	ATT	2	6	31606	31611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015978	T	6	6	31616	31621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015978	ATTA	2	8	31636	31643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015978	ATTA	2	8	31647	31654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015978	T	8	8	31655	31662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015978	CTTTTT	2	12	31664	31675	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_015978	CTTT	2	8	31723	31730	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015978	ATTA	2	8	31742	31749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015978	A	6	6	31768	31773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015978	CGGT	2	8	31790	31797	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015978	TAA	2	6	31814	31819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015978	A	6	6	31818	31823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015978	GGA	2	6	31850	31855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015978	AAAT	2	8	34815	34822	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015978	ACGAG	2	10	34841	34850	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_015978	CT	3	6	34851	34856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015978	AAG	2	6	34882	34887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015978	A	7	7	35765	35771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015978	AGG	2	6	35779	35784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015978	GGA	2	6	35836	35841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015978	TAAT	2	8	37641	37648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015978	ATT	2	6	37650	37655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015978	AGT	2	6	37699	37704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015978	TTAAT	2	10	37725	37734	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015978	TA	3	6	37747	37752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015978	TAG	2	6	40321	40326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015978	T	6	6	40358	40363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015978	T	6	6	40388	40393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015978	TATATC	2	12	40428	40439	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_015978	A	6	6	40470	40475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015978	TTA	2	6	40486	40491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015978	AT	3	6	40527	40532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015978	AAAT	2	8	40664	40671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015978	GGC	2	6	40733	40738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_015978	CGAA	2	8	40758	40765	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_015978	GAT	2	6	40798	40803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015978	AGA	2	6	40856	40861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015978	AAC	2	6	40899	40904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_015978	TGGA	2	8	40954	40961	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_015978	GGC	2	6	41458	41463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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465	NC_015978	AAC	2	6	103298	103303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_015978	CTTA	2	8	109209	109216	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

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